Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabra1P62812 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra1P62812 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra1P62812 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra1P62812 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra1P62812 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra1P62812 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra1P62812 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gabra1P62812 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra1P62812 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra1P62812 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra1P62812 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra1P62812 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra1P62812 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra1P62812 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra1P62812 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra1P62812 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra1P62812 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra1P62812 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra1P62812 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra1P62812 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra1P62812 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra1P62812 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra1P62812 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra1P62812 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra1P62812 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra1P62812 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra1P62812 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra1P62812 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra1P62812 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra1P62812 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra1P62812 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra1P62812 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra1P62812 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra1P62812 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra1P62812 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra1P62812 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra1P62812 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra1P62812 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra1P62812 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra1P62812 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra1P62812 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra1P62812 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra1P62812 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra1P62812 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra1P62812 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra1P62812 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gabra1P62812 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra1P62812 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra1P62812 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra1P62812 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra1P62812 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra1P62812 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra1P62812 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra1P62812 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra1P62812 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra1P62812 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra1P62812 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra1P62812 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra1P62812 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms