Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpd1P62315 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms