Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b6P59708 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms