Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps33bP59016 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps33bP59016 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms