Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhbdl3P58873 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms