Protein–RNA interactions for Protein: P58682

Tlr8, Toll-like receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr8P58682 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr8P58682 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr8P58682 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr8P58682 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr8P58682 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr8P58682 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr8P58682 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr8P58682 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr8P58682 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr8P58682 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr8P58682 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr8P58682 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr8P58682 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr8P58682 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tlr8P58682 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr8P58682 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr8P58682 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr8P58682 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr8P58682 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr8P58682 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms