Protein–RNA interactions for Protein: P58334

Klf16, Krueppel-like factor 16, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf16P58334 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf16P58334 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf16P58334 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf16P58334 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf16P58334 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf16P58334 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf16P58334 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf16P58334 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf16P58334 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf16P58334 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf16P58334 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf16P58334 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf16P58334 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf16P58334 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf16P58334 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf16P58334 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf16P58334 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf16P58334 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf16P58334 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf16P58334 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf16P58334 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf16P58334 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf16P58334 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf16P58334 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms