Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CtnsP57757 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CtnsP57757 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtnsP57757 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtnsP57757 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtnsP57757 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtnsP57757 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CtnsP57757 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtnsP57757 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtnsP57757 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CtnsP57757 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtnsP57757 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtnsP57757 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms