Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp25P57080 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp25P57080 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp25P57080 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp25P57080 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp25P57080 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp25P57080 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp25P57080 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp25P57080 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp25P57080 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp25P57080 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
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