Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Bace1P56818 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bace1P56818 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bace1P56818 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bace1P56818 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bace1P56818 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bace1P56818 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bace1P56818 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bace1P56818 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bace1P56818 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms