Protein–RNA interactions for Protein: P56484

Ccr8, C-C chemokine receptor type 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr8P56484 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccr8P56484 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr8P56484 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr8P56484 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr8P56484 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr8P56484 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr8P56484 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr8P56484 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr8P56484 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr8P56484 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr8P56484 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr8P56484 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr8P56484 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr8P56484 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr8P56484 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr8P56484 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr8P56484 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr8P56484 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr8P56484 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccr8P56484 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr8P56484 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr8P56484 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr8P56484 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccr8P56484 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms