Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp5P56399 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp5P56399 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp5P56399 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp5P56399 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp5P56399 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp5P56399 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp5P56399 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp5P56399 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp5P56399 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp5P56399 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms