Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd3P55096 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms