Protein–RNA interactions for Protein: P54818

Galc, Galactocerebrosidase, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GalcP54818 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GalcP54818 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GalcP54818 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GalcP54818 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GalcP54818 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GalcP54818 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GalcP54818 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GalcP54818 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GalcP54818 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GalcP54818 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GalcP54818 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GalcP54818 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GalcP54818 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GalcP54818 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GalcP54818 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GalcP54818 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GalcP54818 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GalcP54818 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GalcP54818 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GalcP54818 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GalcP54818 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GalcP54818 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GalcP54818 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GalcP54818 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GalcP54818 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GalcP54818 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GalcP54818 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GalcP54818 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GalcP54818 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GalcP54818 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GalcP54818 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GalcP54818 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GalcP54818 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GalcP54818 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GalcP54818 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GalcP54818 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GalcP54818 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GalcP54818 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GalcP54818 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GalcP54818 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GalcP54818 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GalcP54818 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GalcP54818 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GalcP54818 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GalcP54818 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GalcP54818 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GalcP54818 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GalcP54818 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GalcP54818 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GalcP54818 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GalcP54818 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GalcP54818 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GalcP54818 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GalcP54818 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GalcP54818 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GalcP54818 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GalcP54818 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GalcP54818 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GalcP54818 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GalcP54818 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GalcP54818 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GalcP54818 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GalcP54818 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GalcP54818 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GalcP54818 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GalcP54818 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GalcP54818 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GalcP54818 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GalcP54818 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GalcP54818 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GalcP54818 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GalcP54818 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GalcP54818 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GalcP54818 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GalcP54818 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GalcP54818 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GalcP54818 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GalcP54818 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GalcP54818 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GalcP54818 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GalcP54818 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GalcP54818 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GalcP54818 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GalcP54818 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GalcP54818 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GalcP54818 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GalcP54818 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GalcP54818 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GalcP54818 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GalcP54818 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GalcP54818 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GalcP54818 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GalcP54818 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GalcP54818 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GalcP54818 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GalcP54818 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GalcP54818 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GalcP54818 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GalcP54818 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GalcP54818 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms