Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rad23bP54728 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rad23bP54728 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms