Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PctpP53808 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PctpP53808 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PctpP53808 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PctpP53808 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PctpP53808 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PctpP53808 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PctpP53808 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PctpP53808 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PctpP53808 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PctpP53808 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PctpP53808 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PctpP53808 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PctpP53808 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PctpP53808 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PctpP53808 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PctpP53808 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PctpP53808 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PctpP53808 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PctpP53808 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PctpP53808 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PctpP53808 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PctpP53808 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PctpP53808 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PctpP53808 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PctpP53808 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PctpP53808 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PctpP53808 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PctpP53808 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PctpP53808 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PctpP53808 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PctpP53808 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PctpP53808 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PctpP53808 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PctpP53808 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PctpP53808 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PctpP53808 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PctpP53808 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PctpP53808 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PctpP53808 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PctpP53808 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PctpP53808 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PctpP53808 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PctpP53808 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PctpP53808 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PctpP53808 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PctpP53808 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PctpP53808 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PctpP53808 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PctpP53808 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PctpP53808 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PctpP53808 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PctpP53808 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PctpP53808 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PctpP53808 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PctpP53808 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PctpP53808 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PctpP53808 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PctpP53808 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PctpP53808 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PctpP53808 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PctpP53808 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PctpP53808 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PctpP53808 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PctpP53808 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PctpP53808 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PctpP53808 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PctpP53808 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PctpP53808 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PctpP53808 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PctpP53808 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PctpP53808 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PctpP53808 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PctpP53808 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PctpP53808 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PctpP53808 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PctpP53808 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PctpP53808 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PctpP53808 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PctpP53808 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PctpP53808 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PctpP53808 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PctpP53808 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PctpP53808 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PctpP53808 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PctpP53808 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PctpP53808 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PctpP53808 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PctpP53808 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PctpP53808 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PctpP53808 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PctpP53808 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PctpP53808 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PctpP53808 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PctpP53808 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PctpP53808 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PctpP53808 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PctpP53808 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PctpP53808 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PctpP53808 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms