Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RabggtbP53612 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RabggtbP53612 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms