Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cux1P53564 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cux1P53564 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cux1P53564 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cux1P53564 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cux1P53564 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cux1P53564 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms