Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp1P52624 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Upp1P52624 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upp1P52624 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upp1P52624 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Upp1P52624 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upp1P52624 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upp1P52624 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Upp1P52624 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Upp1P52624 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upp1P52624 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms