Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ClgnP52194 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ClgnP52194 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClgnP52194 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClgnP52194 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClgnP52194 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ClgnP52194 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClgnP52194 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ClgnP52194 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClgnP52194 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms