Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms