Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TspoP50637 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TspoP50637 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TspoP50637 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TspoP50637 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TspoP50637 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TspoP50637 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TspoP50637 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TspoP50637 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TspoP50637 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TspoP50637 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TspoP50637 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TspoP50637 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TspoP50637 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TspoP50637 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TspoP50637 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TspoP50637 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TspoP50637 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TspoP50637 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TspoP50637 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TspoP50637 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TspoP50637 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TspoP50637 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TspoP50637 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TspoP50637 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TspoP50637 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TspoP50637 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TspoP50637 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TspoP50637 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TspoP50637 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TspoP50637 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TspoP50637 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TspoP50637 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TspoP50637 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TspoP50637 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TspoP50637 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TspoP50637 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TspoP50637 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TspoP50637 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TspoP50637 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TspoP50637 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TspoP50637 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TspoP50637 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TspoP50637 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TspoP50637 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TspoP50637 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TspoP50637 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TspoP50637 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TspoP50637 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TspoP50637 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TspoP50637 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TspoP50637 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TspoP50637 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TspoP50637 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TspoP50637 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TspoP50637 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TspoP50637 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TspoP50637 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TspoP50637 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TspoP50637 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TspoP50637 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TspoP50637 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TspoP50637 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TspoP50637 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TspoP50637 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TspoP50637 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TspoP50637 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TspoP50637 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TspoP50637 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TspoP50637 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TspoP50637 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TspoP50637 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TspoP50637 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TspoP50637 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TspoP50637 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TspoP50637 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TspoP50637 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TspoP50637 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TspoP50637 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TspoP50637 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TspoP50637 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TspoP50637 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TspoP50637 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TspoP50637 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TspoP50637 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TspoP50637 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TspoP50637 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TspoP50637 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TspoP50637 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TspoP50637 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TspoP50637 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TspoP50637 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TspoP50637 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TspoP50637 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TspoP50637 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TspoP50637 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TspoP50637 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TspoP50637 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TspoP50637 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TspoP50637 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms