Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TgfaP48030 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TgfaP48030 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TgfaP48030 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TgfaP48030 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TgfaP48030 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TgfaP48030 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TgfaP48030 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgfaP48030 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgfaP48030 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms