Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf5P43027 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf5P43027 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf5P43027 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf5P43027 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf5P43027 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf5P43027 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf5P43027 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf5P43027 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf5P43027 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf5P43027 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf5P43027 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf5P43027 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf5P43027 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf5P43027 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf5P43027 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf5P43027 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf5P43027 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf5P43027 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf5P43027 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf5P43027 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf5P43027 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gdf5P43027 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gdf5P43027 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gdf5P43027 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gdf5P43027 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gdf5P43027 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gdf5P43027 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdf5P43027 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms