Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx1-2P42580 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms