Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf2P39429 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf2P39429 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf2P39429 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf2P39429 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf2P39429 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf2P39429 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms