Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtlP38585 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtlP38585 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtlP38585 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtlP38585 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TtlP38585 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtlP38585 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TtlP38585 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtlP38585 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtlP38585 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtlP38585 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtlP38585 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtlP38585 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtlP38585 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtlP38585 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TtlP38585 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TtlP38585 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TtlP38585 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TtlP38585 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TtlP38585 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TtlP38585 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TtlP38585 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TtlP38585 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TtlP38585 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TtlP38585 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TtlP38585 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TtlP38585 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TtlP38585 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TtlP38585 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TtlP38585 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TtlP38585 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TtlP38585 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TtlP38585 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TtlP38585 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TtlP38585 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TtlP38585 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TtlP38585 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TtlP38585 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TtlP38585 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TtlP38585 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TtlP38585 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TtlP38585 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TtlP38585 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TtlP38585 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TtlP38585 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TtlP38585 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TtlP38585 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TtlP38585 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TtlP38585 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TtlP38585 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TtlP38585 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TtlP38585 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TtlP38585 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TtlP38585 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TtlP38585 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TtlP38585 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TtlP38585 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TtlP38585 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TtlP38585 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TtlP38585 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TtlP38585 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TtlP38585 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TtlP38585 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TtlP38585 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TtlP38585 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TtlP38585 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TtlP38585 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TtlP38585 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TtlP38585 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TtlP38585 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TtlP38585 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TtlP38585 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TtlP38585 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TtlP38585 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TtlP38585 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TtlP38585 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TtlP38585 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TtlP38585 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TtlP38585 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TtlP38585 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TtlP38585 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TtlP38585 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TtlP38585 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TtlP38585 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TtlP38585 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TtlP38585 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TtlP38585 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TtlP38585 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TtlP38585 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TtlP38585 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TtlP38585 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TtlP38585 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TtlP38585 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TtlP38585 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TtlP38585 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TtlP38585 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TtlP38585 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TtlP38585 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TtlP38585 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TtlP38585 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms