Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprkP35822 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprkP35822 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprkP35822 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PtprkP35822 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PtprkP35822 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PtprkP35822 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprkP35822 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprkP35822 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprkP35822 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PtprkP35822 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PtprkP35822 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PtprkP35822 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PtprkP35822 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms