Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Grin2aP35436 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Grin2aP35436 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms