Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TpoP35419 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TpoP35419 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TpoP35419 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TpoP35419 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TpoP35419 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TpoP35419 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TpoP35419 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TpoP35419 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TpoP35419 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TpoP35419 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TpoP35419 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TpoP35419 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TpoP35419 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TpoP35419 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TpoP35419 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TpoP35419 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TpoP35419 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TpoP35419 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TpoP35419 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TpoP35419 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TpoP35419 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TpoP35419 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TpoP35419 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TpoP35419 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TpoP35419 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TpoP35419 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TpoP35419 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TpoP35419 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TpoP35419 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TpoP35419 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TpoP35419 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TpoP35419 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TpoP35419 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TpoP35419 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TpoP35419 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TpoP35419 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TpoP35419 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TpoP35419 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TpoP35419 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TpoP35419 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TpoP35419 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TpoP35419 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TpoP35419 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TpoP35419 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TpoP35419 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TpoP35419 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TpoP35419 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TpoP35419 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TpoP35419 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TpoP35419 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TpoP35419 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TpoP35419 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TpoP35419 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TpoP35419 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TpoP35419 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TpoP35419 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TpoP35419 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TpoP35419 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TpoP35419 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TpoP35419 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TpoP35419 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TpoP35419 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TpoP35419 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TpoP35419 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TpoP35419 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TpoP35419 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TpoP35419 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TpoP35419 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TpoP35419 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TpoP35419 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TpoP35419 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TpoP35419 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TpoP35419 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TpoP35419 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TpoP35419 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TpoP35419 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TpoP35419 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TpoP35419 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TpoP35419 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TpoP35419 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TpoP35419 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TpoP35419 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TpoP35419 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TpoP35419 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TpoP35419 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TpoP35419 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TpoP35419 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TpoP35419 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TpoP35419 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TpoP35419 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TpoP35419 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TpoP35419 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TpoP35419 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TpoP35419 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TpoP35419 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TpoP35419 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TpoP35419 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TpoP35419 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TpoP35419 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms