Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp12P34960 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp12P34960 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms