Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcdP28867 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms