Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa2P28309 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa2P28309 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa2P28309 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa2P28309 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa2P28309 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa2P28309 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa2P28309 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa2P28309 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa2P28309 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa2P28309 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa2P28309 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa2P28309 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa2P28309 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa2P28309 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa2P28309 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa2P28309 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa2P28309 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa2P28309 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa2P28309 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa2P28309 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa2P28309 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa2P28309 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa2P28309 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa2P28309 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa2P28309 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa2P28309 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa2P28309 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms