Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psmb9P28076 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psmb9P28076 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms