Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra3P26049 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra3P26049 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms