Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cdk11bP24788 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdk11bP24788 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms