Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd247P24161 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd247P24161 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd247P24161 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd247P24161 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd247P24161 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd247P24161 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms