Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd12P23812 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd12P23812 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms