Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfyaP23708 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NfyaP23708 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfyaP23708 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfyaP23708 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NfyaP23708 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfyaP23708 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfyaP23708 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NfyaP23708 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfyaP23708 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfyaP23708 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfyaP23708 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NfyaP23708 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfyaP23708 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfyaP23708 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NfyaP23708 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfyaP23708 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfyaP23708 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfyaP23708 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfyaP23708 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfyaP23708 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfyaP23708 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfyaP23708 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfyaP23708 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfyaP23708 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfyaP23708 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfyaP23708 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfyaP23708 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfyaP23708 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfyaP23708 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfyaP23708 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NfyaP23708 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfyaP23708 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfyaP23708 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfyaP23708 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfyaP23708 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
NfyaP23708 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfyaP23708 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NfyaP23708 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfyaP23708 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfyaP23708 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfyaP23708 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfyaP23708 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NfyaP23708 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfyaP23708 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfyaP23708 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NfyaP23708 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfyaP23708 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfyaP23708 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfyaP23708 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfyaP23708 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfyaP23708 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NfyaP23708 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfyaP23708 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfyaP23708 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfyaP23708 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NfyaP23708 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfyaP23708 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfyaP23708 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NfyaP23708 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfyaP23708 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NfyaP23708 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfyaP23708 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NfyaP23708 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfyaP23708 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NfyaP23708 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NfyaP23708 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NfyaP23708 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NfyaP23708 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
NfyaP23708 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NfyaP23708 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NfyaP23708 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms