Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZfaP23607 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZfaP23607 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZfaP23607 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZfaP23607 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZfaP23607 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ZfaP23607 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZfaP23607 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZfaP23607 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZfaP23607 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZfaP23607 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms