Protein–RNA interactions for Protein: P22893

Zfp36, mRNA decay activator protein ZFP36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36P22893 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp36P22893 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp36P22893 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms