Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb9P20615 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms