Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fcer1aP20489 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcer1aP20489 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms