Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka3P18654 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms