Protein–RNA interactions for Protein: P15620

Znf271, Zinc finger protein 271, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf271P15620 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf271P15620 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf271P15620 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf271P15620 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf271P15620 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf271P15620 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf271P15620 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf271P15620 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf271P15620 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf271P15620 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf271P15620 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf271P15620 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf271P15620 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms