Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf1P15314 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf1P15314 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf1P15314 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf1P15314 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms