Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Dnmt1P13864 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Dnmt1P13864 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Dnmt1P13864 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Dnmt1P13864 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Dnmt1P13864 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Dnmt1P13864 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Dnmt1P13864 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Dnmt1P13864 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms