Protein–RNA interactions for Protein: P10855

Ccl3, C-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl3P10855 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl3P10855 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl3P10855 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl3P10855 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl3P10855 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl3P10855 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl3P10855 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl3P10855 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl3P10855 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms