Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spta1P08032 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spta1P08032 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spta1P08032 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spta1P08032 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spta1P08032 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spta1P08032 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms