Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb1P04230 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms